Об организации (структуре): управление чего. О деятельности: управление чем.
Что Вы понимаете под правильностью? Что именно Вас смущает в этом сочетании? Ведь в данной конструкции речь идет об определенном бюрократическом термине, вряд ли получится заменить этот термин адекватным синонимом. (Стилистические придирки оставим в стороне.)
"Правильного" варианта нет, нужно обратиться в саму организацию с вопросом о предпочтительном (практикуемом) варианте.
В этом предложении сравнительный оборот выступает в роли сказуемого, поэтому запятая не требуется.
Запятая нужна: соответственно в знач. 'следовательно, значит' обособляется как вводное.
Должность и звание – неоднородные приложения, запятая между ними не ставится. Таким образом, все три указанные запятые не нужны.
Корректен первый вариант.
Их можно различить по синтаксической роли в предложении.
Слово управление требует родительного падежа в значении 'административный орган какого-либо учреждения, предприятия и т. п.': районное управление образования. Если же значение 'регулирование работы', необходим творительный падеж, например: управление образованием – дело непростое.