Правильно: согласно разделу и приложению. Если слово Договор с большой буквы (как условное обозначение), то слова "указанного выше" не нужны.
Выбор формы единственного или множественного числа существительного зависит от того, какое количество задолженностей описывается: если у каждой компании по одной задолженности (или она для них общая), то верен первый вариант; при наличии нескольких задолженностей выбрать нужно второй вариант.
Да, двоеточие как знак отношения отделяется от чисел пробелами.
В такой конструкции требуется согласование по винительному падежу (допустить кого?).
Оба варианта возможны, но первый будет означать, что речь идет о нескольких видах чая и сока.
См. учебник Е. И. Литневской, раздел "Склонение существительных".
Буквенное наращение ставится после последнего числительного.
Оба варианта не вполне корректны, следует перестроить предложение.
