Да, в этом случае слова на самом деле обособляются как вводные.
Запятая не нужна ни перед и, ни перед да: Утреннюю тишину нарушали лишь всплески воды, скрип уключин да крики чаек и бакланов.
Корректно: 23 марта в предместье Вены, на вилле Эрдоди, Сикстуса принимает император Карл.