Странное выражение. Имеется в виду некий орган, управляющий культурой? Поясните, пожалуйста.
Правильно: крови.
Корректно: регулирующий орган (регулятор).
Беспредложный вариант (орган сертификации) лучше.
Словосочетание орган по сертификации пишется со строчной буквы, так как оно не является названием конкретного учреждения или организации.
Из этимологических словарей следует, что слова сокровенный и кровь не родственные.
Перед приложением может стоять тире (соисполнитель — федеральный орган исполнительной власти) или запятая в зависимости от строя предложения.
Запятые не нужны, верно: Министерство как уполномоченный орган исполнительной власти сообщает следующее... Оборот с союзом как не выделяется, если передает значение 'в качестве' (= Министерство в качестве уполномоченного органа исполнительной власти сообщает следующее...).