Правильно: со склада.
Правилен первый вариант.
Ваш вариант пунктуационного оформления предложения корректен.
Правильно: со склада. Предлог из антонимичен предлогу в, предлог с – предлогу на. Правильно: на складе (не в складе), поэтому со склада.
Правильно: пятидесятипроцентная скидка.
Да, этот корень можно отнести к чередующимся. См. ответ на вопрос № 267619.
Лучше: скидка на товары из каталога.
Скидка 20 процентов, двадцатипроцентная скидка.