С произносится мягко. Произношение [сэ] неправильно.
Правильно: благодаря ей.
Верен первый вариант.
Корректно без запятых.
Предпочтительно: Раньше мы ею не занимались. Допустимо: Раньше мы ей не занимались.
Возможны оба варианта: выпить чаю, прибавьте мне салату (в разговорной речи) и выпить чая, прибавьте мне салата (стилистически нейтральный, общеупотребительный вариант).