Корректно: наши хобби.
Кавычки не ставятся.
Если в скобки заключено самостоятельное предложение, то и точка ставится внутри скобок.
Допустимо: Организовать проведение ознакомительной практики студентов 3 курса отделения "Фармация" Самарского медицинского колледжа (1-й поток).
Действительно, фраза звучит по-канцелярски. И ведь не обязательно родители должны читать - есть и другие "чтецы" :)
Оба варианта возможны.
Лучше: во втором и окончательном чтении.
Пунктуация верна.