Правильно: потери обеих сторон; обе стороны в сражении понесли большие потери.
Форма числительного обе – обеих (обеих книг), форма числительного оба – обоих (обоих окон).
Правильно: обеих женщин.
В подобных контекстах сочетание в конце концов вводное. Обратите внимание, что в первом предложении после подлежащего, выраженного личным местоимением, тире не требуется.
Слово пока здесь не вполне подходит по смыслу. Лучше: Они точно знали, сколько горит свеча или Они точно знали, как долго горит свеча.
Да, корректно.