Для начала нужно определить часть речи.
См. раздел «Принципы морфемного анализа слова» в учебнике Е. И. Литневской.
Фамилия Муха склоняется так же, как и соответствующее нарицательное существительное: Мухи, Мухе, Муху и т. д.
Да, фамилия Муха склоняется (и мужская, и женская). Правильно: тетрадь Мухи Анастасии.
Порядок разборов (в том числе морфологического) см. в учебнике Е. И. Литневской.
В этом слове не нужно выделять окончание. Все слово представляет собой корень и основу.
См. в учебнике Е. И. Литневской.