София и Софья – это варианты одного имени (как Наталия и Наталья). Имена Соня, Фуфа могут быть "домашними" вариантами разных имен, в том числе имени Софья.
Да, верно: Генеральная Ассамблея ООН. Ответ исправлен. Спасибо за замечание!
Оборот с предлогом кроме обособляется.
См.: КРОМЕ (кого, чего)
Слово республика при употреблении вне полного названия государства пишется со строчной: Недавно нашу республику посетили с официальным визитом...
Правильно: Яффа, это название склоняется: посетили Яффу.
Оборот не выделяется.
Болельщики планируют? Если да, то планируют.
Нет, запятая не нужна.
В орфографическом словаре рекомендовано написание: Совет безопасности, однако в «Кратком справочнике по оформлению актов Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации» зафиксирован первый вариант (все слова с прописной).