В первом подвергается сомнению факт "он мастер" (о том, кто не должен быть мастером), во втором - факт "он не мастер" (о том, кто считается мастером).
Допускается обособление при авторском интонационно-логическом выделении этого оборота.
Правилен второй вариант.
Если определение (обычно обособленное) стоит после счетного оборота, то чаще оно ставится в форме именительного падежа множественного числа, поэтому корректно: Ремонт с заменой телефонов на два телефона, ранее установленные в офисе.
Если речь идет о запятой после знаю, то она ставится по правилам пунктуации в сложноподчиненном предложении. Слова зачем и кому являются союзными словами, которые присоединяют придаточную изъяснительную часть. Если речь идет о непоставленной запятой перед союзом и, то она действительно не ставится между однородными союзными словами.
«Но» относится к раздельному написанию вместо слитного.
Обособление не требуется.
Запятые не нужны.
Лучше так: выдать новый исполнительный лист взамен выданного ранее.