Вы правы, формы совпадают.
Корректно: рассчитаться с помощью карты, рассчитаться картой (ср.: рассчитаться наличными).
Второй вариант кажется нам более удачным, чем первый.
Корректно: начислить процент на остаток на карте.
Правильно в кавычках: парк "Ладожские шхеры".
См. в "Письмовнике": Реальные собственные имена и условные наименования различаются синтаксической сочетаемостью. Ср.: Большой театр, Театр сатиры, Театр на Юго-Западе – это реальные собственные имена, в них присутствует синтаксическая сочетаемость, кавычки не нужны. Но: театр «Современник», театр «Школа современной пьесы» – условные наименования, не сочетающиеся синтаксически с родовым словом. Они заключаются в кавычки. Аналогично: парк Дружбы, но: парк «Сокольники», Коммунистическая партия Российской Федерации, но: партия «Яблоко» и т. д.
Правильно: книги Эриха Марии Ремарка.
Правильно: Марии.
Верно: над г. Москвой.
Выражение реквизиты карты верное и широко употребляется.