Верно слитное написание: Верхнепышминский район.
Запятая нужна, она ставится между частями сложного предложения.
Запятая факультативна. Здесь подробности: https://gramota.ru/biblioteka/spravochniki/spravochnik-po-punktuatsii
Основных - три: определение, обстоятельство, дополнение. Иногда в школьной программе рассматривают также приложение.
Можно поставить интонационное тире, но не обязательно.
Здесь пишется ни.
Верно: ...все равно будет непонятно, куда нам идти.
В значении "опуститься, стать на колени" - преклонить колени (колена).
Если слова с полками до потолка, скрипучими полами и приглушенным светом используются как пояснение, то можно поставить как тире, так и двоеточие.
Если Вы уверены, что предложение выглядит именно так, то да – это частица, она выделяется запятыми: Вам нужно, да, заполнить анкету. Но дело в том, что таким образом предложения строятся довольно редко. Частица да обычно стоит в начале предложения.
Или (если фразу записывали на слух), может быть, имеется в виду дозаполнить анкету?