Это сложноподчиненное предложение, в котором придаточная часть (изъяснительная) находится перед главной частью и присоединена к ней союзом-частицей ли. Поскольку в начале придаточной части находится сочетание союза и частицы а вот, перестановка частей невозможна (сравним: *По сей день остаётся загадкой, а вот может ли она летать на самом деле), между частями предложения нужно поставить тире: А вот может ли она летать на самом деле — по сей день остаётся загадкой.
В данном случае это вводное слово, выражающее предположение: Может, что-то случилось?
Перед тире нужна запятая: с ее помощью выделяется придаточная часть.
В качестве названия исторического периода корректно написание с прописной буквы.
Это сочетание в кавычки не заключается.
Орфографически верно: в отраженье, в отражении. См. также ответ на вопрос № 176838.
Верно: крестить по католическому обряду, в католической церкви.