Оба варианта верны.
Верно: было представлено 50 работ, имевших; были представлены две работы, имевшие... Причастие стоит в том же падеже, что и существительное.
Возможны варианты. Обстоятельственные обороты «несмотря на + существительное» обычно выделяются знаками препинания (запятыми). Но при тесной связи оборота со сказуемым (если смысл предложения: работы не просто продолжатся, а продолжатся именно вопреки трудностям) запятая не ставится.
Предложенный Вами вариант пунктуационного оформления корректен.
Избыточно сочетание "практика работы".
Никакие знаки препинания (кроме точки в конце предложения) не нужны.
Катя, мы не располагаем текстам такой контрольной.
В значении "непрерывно" правильно: без перерывов.
Здесь сочетание в свою очередь употреблено в роли члена предложения в значении «со своей стороны, в ответ, когда наступила очередь» и не требует обособления, см. «Справочник по пунктуации».