Оба варианта возможны. Подробные рекомендации см. в «Письмовнике».
Корректно: высота – три тысячи метров.
Правильно: три бинта.
Корректно: три контурные упаковки. При существительных женского рода, зависящих от числительных два, три, четыре (а также от составных числительных, оканчивающихся на указанные цифры), определение, находящееся между числительным и существительным, в современном языке ставится, как правило, в форме именительного падежа множественного числа.
Правильно: неделимое на три число.
Возможно: инструкция по стрельбе, инструкция по уходу, инструкция министерства, инструкция на русском языке, инструкция для сотрудников.
Верно: три бутЫли, пять бутЫлей. Это слово женского рода, ударение во всех формах падает на Ы.
Сочетание трое сестер недопустимо: собирательные числительные не употребляются с существительными, называющими лиц женского пола. Правильно: три сестры.