Запятая не нужна. Нет оснований для ее постановки.
Запятая поставлена корректно.
В этом предложении имя собственное является подлежащим, его не нужно обособлять.
Нормой современного литературного языка является произношение этого термина с ударением на третьем слоге: аксиогра́фия. Однако в профессиональной речи медиков ударение в словах с финалью на -ия нередко перемещается на первый гласный финали -и́я: мани́я, фоби́я, рефлекси́я и т. п.
Правильно: Данный аттестат свидетельствует о том, что (ФИО ребёнка) окончил государственное общеобразовательное учреждение «Гимназия № 343».
Правильно (с зависимыми словами): тушенное.
Обособление имени в общем случае не требуется. Оно возможно, только если автор хочет придать этому имени характер попутного замечания, то есть если для него важно, что это был герой «Преступления и наказания», а что это за герой — информация второстепенная.