В данном случае запятые возможны, если пишущий подразумевает, что с их помощью отделяются обстоятельства образа действия.
Корректно: для налогоплательщиков – организаций, а также физических лиц – устанавливается...
Частица пишется слитно с последующим прилагательным.
Обращение – слово многозначное; по-видимому, именно это Вас и смутило. Первое значение данного существительного – действие по глаголу обратиться – обращаться; в этом смысле Ваше заявление, конечно же, является обращением к начальнику. И указывает на лицо, к которому Вы обращаетесь, местоимение Вас.
Однако слово Вас не является обращением в лингвистическом смысле этого слова. В грамматике обращение (лингвистический термин) – это слово или словосочетание, называющее лицо (реже – предмет), к которому обращена речь. Обращение грамматически не связано с предложением, не является членом предложения, может занимать в предложении любое место. Обращение выражается существительным (или любой частью речи в функции существительного) в форме именительного падежа. Именно такое обращение выделяется запятыми (или после него ставится восклицательный знак). Вот примеры: Не вешать нос, гардемарины! (Ряшенцев). Автобус новенький, спеши, спеши (Окуджава). Здравствуйте, Иван Петрович!
В рассматриваемом же предложении местоимение Вы стоит в форме винительного падежа, является членом предложения – дополнением (прошу кого? – Вас) и не может быть переставлено в другое место предложения (невозможно: прошу предоставить мне Вас отпуск, но ср.: прошу предоставить мне, Иван Петрович, отпуск). Местоимение Вас не является обращением и не требует постановки запятых. А пишется оно с прописной буквы согласно правилу: местоимение Вы пишется с прописной при вежливом обращении (действии!) к одному лицу.
Такого правила не существует. С большой буквы при обращении к одному лицу и с маленькой при обращении к нескольким лицам пишутся только местоимения Вы, Ваш.
Теоретически слова милый, любимый, родной и т. д. могут быть написаны с большой буквы, если автор приписывает им особый высокий смысл. Но это будет индивидуально-авторское написание, отклоняющееся от общей нормы.
Кавычки не нужны, но в целом предложение стилистически небезупречно, лучше заменить слово лицо либо перестроить всё предложение.
Порядок слов в названиях улиц, переулков и под. может варьироваться в некотрых пределах. В тексте следует соблюдать прямой порядок: 1-й переулок Пушкина или Первый переулок Пушкина. В списке (например, в словаре, реестре, то есть там, где предполагается поиск по алфавиту) на первое место выносится основной компонент названия: Пушкина 1-й переулок. Образцовый словарный порядок можно найти в «Словаре улиц Москвы».
Верно: ...в лице директора Бендера Остапа Ибрагимовича, действующего на основании Устава.