Предпочтительный перенос: не-тварный. При переносе надо учитывать членение слова на значимые части (не – приставка, твар – корень).
Плохо и так и так. Можно использовать графическое сокращение (с точкой): терр. органы.
Постановка запятой не требуется.
Запятая ставится.
Верное написание: метаанализ.
Обговорить – разг. то же, что обсудить. У слова оговорить значений несколько, см. словарную статью.
Правильно: стоящий инструмент (от стоять), стоящий инструмент (от стоить).
Как официальное название государственного органа: Совет депутатов.
Это равноправные варианты. В любом контексте они взаимозаменяемы.
В деловой переписке обычно употребляется форма множественного числа второго лица (распечатайте). Слово пожалуйста в деловой переписке не запрещено. Вводное слово пожалуйста выделяется запятыми.