шифр
ШИФР, ши́фра, мн. ши́фры, ши́фрам \\ в форме шифр – ши[фр] и допуст. ши́[фəр]; в форме ши́фре – ши́[ф]ре.
шить
ШИТЬ, шью, шьёт \\ в формах с сочетанием шь: шью... – [шj]ю.
литр
ЛИТР, ли́тра, мн. ли́тры, ли́трам \\ в форме литр – ли[тр] и допуст. ли́[тəр]; в форме ли́тре – ли́[т]ре.