чи́слить(ся), -лю(сь), -лит(ся)
ЧИ́СЛИТЬСЯ, чи́слюсь, чи́слится \\ чи́[с’]литься и допуст. младш. чи́[с]литься; в формах с сочетанием м[с’]: чи́слимся... – чи́сли[м]ся; в форме чи́слятся – чи́с[л’ə]тся и допуст. устарелое чи́с[л’у]тся; в форме чи́слился – чи́сли[л]ся; в формах с сочетанием ящ: чи́слящийся... – чи́с[л’ие]щийся и допуст. устарелое чи́с[л’у]щийся; о произношении форм с конечными -ся, -сь см. § 145.
Ответы справочной службы
Глаголы "присутствовать", "находиться" и "числиться" различаются в первую очередь смысловыми оттенками, в конечном счете выбирать Вам исходя из требуемого содержания. Если в Вашем случае нельзя избежать использования слов "в подведомственности", то следует просто руководствоваться толковым словарем. Обратите внимание на синонимические ряды (приводим синонимы только для актуальных значений): присутствовать = иметься, наличествовать; находиться = располагаться, быть, пребывать; числиться = "иметься у кого-либо или быть в каком-либо состоянии согласно записи, документу и т. п.". Просим также обратить внимание на то, что глагол "присутствовать" в указанном значении вполне корректно сочетается с неодушевленными существительными.
Кстати, сочетание "подразделение организации находится на территории, подведомственной определенному налоговому органу" кажется нам более удачным. Может быть, так и оставить?
Вместо "находиться в подведомственности" лучше сказать подчиняться, быть в управлении кого-либо.