начисле́ние, -я
НАЧИСЛЕ́НИЕ, начисле́ния, мн. начисле́ния, начисле́ниям \\ начи[с’]ле́ние u допуст. младш. начи[с]ле́ние; начисле́[н’и]e u начисле́[н’й]e, в беглой речи возможно начисле́[н’н’]e и начисле́[н’]e.
Ответы справочной службы
Корректно: Начисление миль производится за покупку недвижимости: жилая недвижимость (новостройки / вторичное жилье), загородная недвижимость и/или коммерческая недвижимость (список объектов размещен на сайте).
Перечитали Ваш вопрос трижды и не нашли противоречий. Действительно, форма единственного числа (пеня) считается устаревшей, и рекомендуется употреблять форму множественного числа: пени, пеней, пеням и т. д.
Если в предложении нет противопоставления (не начисление премии, а...), правильно слитное написание.
Правильно раздельное написание.