Словари
гекса́эдр, -а
ГЕКСА́ЭДР, гекса́эдра, мн. гекса́эдры, гекса́эдрам \\ [г’]екса́эдр; гекса́[ие]др и допуст. гекса́[э]др, в беглой речи возможно гекса́[й]др; в форме гекса́эдр – гекса́э[др] и допуст. гекса́э[дəр]; в форме гекса́эдре – гекса́э[д]ре.
Справочники
§ 6. Буква э пишется в начале корня для передачи гласного э (без предшествующего [j]): В начале следующих исконно русских местоименных слов и междометий: этот (эта, это, эти), этакий, эдакий, экий, этак, эдак; эва, эвон, эге, эгеге, эй, эк, эх, эхма, эхехе. В начале слов иноязычного происхождения (в том числе собственных имен), напр.: эврика, экспорт, экстренный, эллин, эпос, эра, этика, эхо, Этна, Эрик (с буквой э, передающей ударный гласный);
...предшествующей буквы пишутся с э слова со второй частью -эдр: гексаэдр...
