Следует писать строчными буквами: дальняя авиация, гражданская авиация.
Следует писать слитно.
Если существительные и прилагательные в сочетании с не обозначают непринадлежность к какому-либо разряду лиц или явлений, эти слова пишутся слитно: неврачи, нефраниузы, немарксисты, нехристиане, неспециалисты, немосквичи и т. д.
Указанная запятая не нужна.