Допустимо написание Великая теорема Ферма и Малая теорема Ферма с прописной буквы, поскольку это собственные названия теорем, хотя в специальной литературе малая теорема Ферма чаще всего пишется со строчной буквы. Остальные понятия следует писать со строчной буквы: метод факторизации Ферма, спираль Ферма, точка Ферма, числа Ферма.
Верно: реализуется в г. Перми.
Корректно со строчной: ферми-газ, ферми-жидкость.
Правильно: мини-ферма, но мини молочная ферма. По правилам недопустимо слитное или дефисное написание с приставкой или первой частью сложного слова, если вторая часть представляет собой сочетание слов. В этом случае необходимо раздельное написание.
Правильно: Я слышал, что мороженое с фермы У. просто объедение! Запятая ставится один раз – между главным и придаточным предложением. Тире между подлежащим и сказуемым, выраженными именительным падежом существительного, не ставится, если между подлежащим и сказуемым стоит вводное слово, наречие, союз, частица.
Корректно: страусиная (страусовая) ферма.
Предлоги выражают несколько различный смысл. Например, можно интерпретировать так. С фермы - с места производства. От фермы - от сотрудников фермы.
В этом предложении запятые не нужны.
При уточнении - нужна: Недавно я был у себя на родине, (а именно) в Перми.
Правильно: в г. Перми. См. «Письмовнике».