В первых двух примерах возможны оба варианта. При этом форма единственного числа сказуемого указывает на совместное действие, форма множественного числа – на раздельное совершение действия.
В третьем случае верно: Двадцать один человек ушел. При составных числительных, оканчивающихся на один, сказуемое, как правило, ставится в форме единственного числа.
Вот подробная словарная рекомендация:
уголь, угля, углём; мн.угли, углей (вещество, используемое как топливо); состав с углём; топить углём
уголь, угля, углём; мн.угли, углей, углями, (на) углях и (устар.разг.) уголья, угольев (кусок пережжённого дерева);обжечься углём из костра; быть, сидеть как на угольях (на углях)
уголь, угля, углём; мн. угли,углей, углями (материал для рисования); портрет нарисован углём
Ушли с фабрики - корректно.
Правильно: Три сотрудницы ушли в декрет. Собирательные числительные (двое, трое, четверо...) в литературном языке не употребляются со словами, называющими лиц женского пола.
Кавычки не нужны.
Форма прошедшего времени здесь используется в значении повелительного наклонения. Такое употребление маркируется как грубое.
Возможный вариант пунктуации: Лишние килограммы ушли, как дети в школу. Или: Лишние килограммы ушли, как дети, в школу. Эти варианты различаются по смыслу.
Здесь верно: начальник с подчиненными ушли вовремя. Ср.: начальник ушел с подчиненными.