Правильно: Кутафья башня, Кутафьей башни, Кутафьей башне, Кутафью башню, Кутафьей башней, о Кутафьей башне.
Сочетание наклонная башня корректно. Но можно сказать и наклоненная.
Чаще говорят: на водяную баню.
Сочетание часовая башня со значением 'башня с часами' существует и широко употребляется.
Полагаем, что здесь нет переноса: слово устроить употреблено в своем прямом значении ‘подготовить’, ‘обеспечить функционирование чего-либо’.
Пунктуация верна.
Можно сказать: затопил печь (в доме).
Чтобы ответить на Ваш вопрос, нужно точно знать, о каком проекте идет речь. Например, если это название микрорайона, то кавычки не нужны (Город Непохожих); если название организации, то нужно написать без кавычек и второе слово со строчной буквы: «Город непохожих».