Запятые не требуются: Главному бухгалтеру Ивановой С. И. произвести списание.
Вероятно, должно быть: согласно актам, утвержденным комиссией.
Сочетания имеют разное значение. Документы на списание - те, которые списывают, либо те, в которых содержится указание на списание. Документы о списании - те, в которых содержится информация о списании.