Сказаться — отразиться на ком-, чем-л., повлиять на кого-, что-л. Так, возможно и, например, сочетание (что-то) хорошо сказалось (на чем-то).
Поэтому сочетание отрицательно сказаться полностью корректно.
Сочетание чувствую запах общеупотребительное и стилистически нейтральное, слышу запах – разговорное.
Да, корректно выделить значит запятыми с двух сторон.
Следует поставить тире или воздержаться от постановки знака препинания.
Правильно.
Это возможно. В таком случае окончание принято называть внутренней флексией.