Правильно склонять (как в первом варианте). Подробнее см. в «Письмовнике».
Возможна постановка запятой (в случае интонационно-логического выделения).
Правильно: Николя-Жак Конте.
Мужская фамилия Атанесян склоняется, женская – нет. Правильно: тетрадь Атанесяна Николая (но: тетрадь Атанесян Марии).
Имя не склоняется.