Верен первый вариант.
Запятая не нужна, название раздела – это не уточнение.
Лучше: потеряно, это стилистически нейтральный вариант. Утеряно – канцелярское слово.
Правильно: согласно разделу и приложению. Если слово Договор с большой буквы (как условное обозначение), то слова "указанного выше" не нужны.
Можно, ошибки не будет.
Запятая перед согласно необязательна.
Вячеслав, пожалуйста, напишите нам: portal@gramota.ru. Спасибо!