Предложение построено неудачно. Нужно его переформулировать.
Может быть, лучше сказать "дополнительный урон от чего-либо"?
Корректная пунктуация: Он по памяти поставил их не туда, куда нужно, а может быть, и в самом деле это была прибавка со стороны нового хозяина...