Если договор подписал генеральный директор, то верно: договор, подписанный генеральным директором.
Запятая не нужна.
Можно так: подписанный сторонами с помощью электронно-цифровой подписи.
Есть все основания предполагать, что такого рода соединения слов могут быть использованы для выражения противопоставления. Более определенно обсуждать это необходимо с опорой на контекст.
Верно: Аемшей (Аемшой) Геннадием.
Главный организатор мероприятия – подчинённый Ивана Ивановича дядя Вася.
Употребление форм прочтённый, непрочтённый возможно, эти формы корректны.
Варианты различаются по смыслу. Видимо, правильнее: экземпляр, подписанный (обратите внимание, что нужно поставить запятую).