Мужскую фамилию Пирожок надо склонять, женская фамилия не склоняется. Возможно склонение мужской фамилии с выпадением гласного (Пирожка, Пирожку) и без выпадения гласного (Пирожока, Пирожоку). Второй вариант предпочтителен (чтобы отделить фамилию от омонимичного нарицательного существительного), но окончательное решение – за носителем фамилии.
Одушевлять "Пирожок" по аналогии с Колобком все-таки некорректно.
Конечно, правильно. У этого слова есть формы всех падежей, не только именительного.