Правила обособления см. в разделе Запятая (при определительных и обстоятельственных оборотах).
Как свидетельствуют словари, форма единственного числа существительного шпроты вариантна: шпрота и шпрот.
Выделяются факультативно.
Обороты с предлогом независимо от могут обособляться в некоторых случаях (при интонационно-логическом выделении).
См. «Справочник по пунктуации».