Алломорф – это вариант морфемы, например: [дуп] – [дуб], брать – беру, весной – весною. Вы имеете в виду варианты [обуф'] (обувь) – [обув] (обувной)?
Вы написали верно: не совсем обычный.
Правильно: высокий темп.
Запятая после поэтому не нужна.
Раздельное написание допускается, если тем самым подчеркивается отрицание (в знач "отнюдь не обычный).
В сочетании не обычный учебник, она лечебник есть отношения противопоставления, которые и побуждают к раздельному написанию.