Вставка кто бы мог подумать выделяется с двух сторон либо тире, либо скобками.
Энциклопедические словари не являются нормативными в вопросах орфографии и пунктуации. О пунктуации при словах такой как см. в «Справочнике по пунктуации».
Вы совершенно правы. Верный вариант: ул. Карла Маркса, д. 12, кв. 50.