Вы написали правильно.
Предпочтительно: не оставляйте чашки (пакеты), так как речь идет о конкретных предметах.
Да, в этом случае слова на самом деле обособляются как вводные.
Согласно «Русскому орфографическому словарю», правильно: кофемашина.
Сочетание "Где ты есть?" в принципе возможно, однако достаточно: Где ты?
Гласный при склонении не исчезает: Гашека, Чапека, Яначека и т. п.
Указанная запятая не требуется.