Такое сочетание неупотребительно.
Корректно: боец ОМОНа, сотрудник МУП. Подробнее см. в «Письмовнике».
Запятая не ставится.
Согласно «Морфемно-орфографическому словарю» А. Н. Тихонова, в этом слове корень -кал-.
Кавычки в этом случае не требуются. Ср.: село Лесное.