Правильно.
Верно: в девяноста девяти случаях.
Правильно здесь: ...рублей.
Корректно: ...набор учащихся в 9-е классы или набор учащихся, окончивших 9-й класс.
Ошибки нет.
Верно: На девяносто девяти целых восьми десятых процента территории.
Это наречия или предлоги (детально - в соответствующих словарных статьях).
Правильно: в девятистах километрах.
Предложение построено неудачно. Возможен вариант: Файл содержит сведения примерно о семидесяти девяти тысячах сделок.