Верен второй вариант.
Корректно: из озера Байкал.
Слова около церкви выделяются, если носят уточняющий характер. Решение о постановке знаков препинания принимает автор текста.
Верно: три основных типа.
В этой форме слова окончание нулевое.
Вы совершенно правы: в данном предложении слово выделить употреблено в значении «обособить, отделить от общего, целого; вычленить".
Формулировка вопроса разговорная, но корректная.
Верно: ...в размере девяноста одного миллиона рублей РФ.