Кальмар – существительное одушевленное. Правильно: варить кальмаров.
В этом предложении возможны варианты пунктуации. Если готовность наступает ровно через два часа, то сочетание до готовности является пояснительным членом предложения. В этом случае запятая ставится. Если же варить нужно до готовности, которая наступит примерно через два часа, то запятая не нужна.
Оба варианта правильные.
См. ответ № 240684.