Правильно: заём от брокера. С вниманием отнесемся к описанию слова заем в словарях. Стилистической пометой «разговорное» снабжен вариант займ.
Запятая не нужна, однако предложение построено неудачно. Можно поправить: ...Уведомлен о том, что денежные средства Клиента будут храниться на специальном брокерском счете вместе с денежными средствами других клиентов Брокера, а также уведомлен о праве Клиента хранить денежные средства у Брокера на отдельном счете за отдельную плату.