Если это всё предложение, запятая не нужна.
Корректно: Маленькая, плотная положительно заряженная структура в центре атома.
Можно поставить тире при пропуске слова.
Внимательный
Внимающий
Спасибо за внимание
Принимая во внимание
Обратите внимание
Если это всё предложение, запятая не нужна.
Корректно: Маленькая, плотная положительно заряженная структура в центре атома.
Можно поставить тире при пропуске слова.