В сочетании Великий магистр (в знач. 'глава ордена') первое слово пишется с большой буквы.
Следует ориентироваться на словарную фиксацию. «Словарь собственных имен русского языка» Ф. Л. Агеенко фиксирует оба варианта: Сен-Тропе и Сен-Тропез. При этом в качестве основного, предпочтительного варианта дается Сен-Тропе.
Склонение фамилий, оканчивающихся на гласный, не зависит от пола носителя. Фамилия Благиня склоняется (и мужская, и женская): Благини, Благине, Благиню, Благиней, о Благине.
Время обозначается через двоеточие: 16:00. См. ГОСТ ИСО 8601–2001 «Представление дат и времени. Общие требования» (введен в действие 01.07.2002, взамен ГОСТ 7.64–90).
Да, верно: Заболотнему.
Корректно: ухудшение здоровья, осложнение болезни.
Корректно: отчет о проделанной работе.
Да, требуется склонение, в том числе и при употреблении названия в функции приложения.
Об ударении следует спросить у конкретного носителя фамилии.
Верен первый вариант.