Допустимы оба варианта, но первый, в котором учитывается граница между приставкой и корнем, предпочтителен. Подробнее см. в ответе на вопрос № 294651.
Запятая перед и нужна.
Запятая не нужна.
1. Между нарицательными именами существительными, сочетание которых выполняет определительную функцию при имени существительном, пишется тире: Система человек — машина; Отношения учитель — ученик; Проблема рыночные отношения — социальная справедливость.
2. Если сочетание является официальным названием, то кавычки и заглавная буква уместны, ср.: Статья В. А. Сухомлинского «Педагог — коллектив — личность».
Корректно: Комиссия по урегулированию излишков/недостач, выявленных при совершении кассовых операций, хранении и перевозке ценностей, решила...
Запятая не требуется.
Чтобы решить, нуждается ли сочетание в самом деле в обособлении, нужен более широкий контекст: оно является вводным, если с его помощью автор подтверждает что-либо, признает справедливость предшествующего высказывания. В значении 'в действительности' это сочетание не вводное.
В этом восклицательном предложении содержится частица не: Да с кем они только не танцевали!
Приложения, указывающие на спортивное звание и на спортивную специализацию, неоднородны и не требуют разделения запятой: Бронзовый призер Олимпийских игр пловец Олег Синицын заявил о завершении карьеры.
Очевидно, исследуемые препараты представляют собой производные лимонной кислоты. Если так, то необходимо тире: Исследования инновационных препаратов — производных лимонной кислоты.