В этом предложении можно выделить с двух сторон обстоятельственный оборот при рассмотрении заявления в соответствии с ФЗ и проверке представленных документов (он находится между подлежащим и сказуемым).
Правильно: принимать по две капсулы в день.
В значении 'по мере сил' слова как мог, как могли и т. д. не обособляются. Верно: Мы гоняли их как могли, когда вас увидели.
Запятая перед чем не требуется.
Запятая перед как нужна: она ставится между частями сложноподчиненного предложения.
Верные варианты: более-менее и более или менее.
Да, дефис после неизменяемого приложения нужен.
Оба словаря хороши. С. А. Кузнецов учитывал при составлении своего словаря опыт более поздних источников (в частности, опыт Малого академического словаря и Словаря русского языка С. И. Ожегова).
"Страх перед деньгами" лучше читается, так как нет многозначности родительного падежа.