Верно: Распоряжение адресовано всем руководителям отделов и заведующим кафедрами.
Кавычки уместны, особенно если указываются версии программы, например: «1С:Бухгалтерия 8», конфигурация «1С:Бухгалтерия УСН 7.7» и т. д. Кавычки подскажут читателю, что вся эта последовательность цифр, букв и слов составляет одно название. Если просто употребляется обозначение 1C, то в принципе можно обойтись без кавычек: программа 1С. Но если название 1С используется в тексте наряду с более сложными обозначениями, то для единообразия корректно и его заключать в кавычки.
Запятая факультативна.
Здесь "кто строит" - придаточная часть сложного предложения. Запятая нужна.
Пожалуйста, поясните, какие обозначения Вы называете "новыми", а какие - "старые".
Верен первый вариант.
Форма изъявительного наклонения: вы ищете.
Вместо запятой предпочтительно двоеточие (между частями сложного бессоюзного предложения).
