Правильно: с Лебяжьим (топоним при склонении сохраняет формы притяжательного прилагательного).
Это значит быть пойманным при явных уликах, на месте преступления.
Поскольку при однородных членах есть обобщающее слово всё, запятая нужна.
Правильно: в ходе анализа документа установлено; при анализе документа установлено.
Это слово образовано при помощи суффикса -к- от глагола поговорить.
Слово подводник образовано от прилагательного подводный при помощи суффикса -ик.
При наличии паузы тире ставится, а если паузы нет — не ставится.
Подробно о пунктуации при слове значит см. в «Справочнике по пунктуации».
Слитное написание корректно, но при подчеркивании отрицания можно писать и раздельно.
При отсутствии противопоставления не пишется слитно: нереализация проекта, неотправка заказной корреспонденции.