Правильно: о сотнях тысяч человек.
Правильно: 1,8 миллиона легковых автомобилей; 248 тысяч грузовых автомобилей.
Верно: в пяти тысячах случаев.
Верно: суммы, эквивалентной тысяче долларов.
Словарная рекомендация: тысяча, -и, тв. тысячей и тысячью, р. мн. тысяч.
Да, редукция в этом случае происходит. Звук э может находиться только в ударной позиции; попадая в безударную, он редуцируется. В школе обычно этот безударный звук называют звуком [и], хотя правильнее говорить о некотором промежуточном звуке между [и] и [э]. Его называют и с призвуком э и обозначают так: [иэ]. Ср.: тема [т'э] – тематический [т'иэ], о враче [ч'э] – о тысяче [ч'иэ].
Оба варианта корректны. Запятая ставится, если слова с учетом НДС выступают в роли попутного замечания, пояснения (и выделяются интонацией).
Верен второй вариант.